Группа исследователей из Дюссельдорфского университета имени Генриха Гейне реконструировала древнейшую метаболическую сеть, общую для всех ныне живущих организмов. Они обнаружили, что ключевые ферменты у бактерий и архей развивались отдельно. Это указывает на то, что переход к свободноживущим клеткам произошел как минимум дважды.
Ученые предполагают, что бактерии и археи появились независимо друг от друга, эволюционировав из последнего универсального общего предка (LUCA), который сам не был полноценной клеткой и, согласно, авторам, не может считаться полноценным живым организмом. Исследование опубликовано в журнале Science Advances.
Методология работы строится на сравнении генов, кодирующих метаболические ферменты, у современных бактерий и архей. Ученые выявили общий набор реакций, унаследованных от LUCA, но также обнаружили, что обе группы выработали уникальные белковые катализаторы для выполнения одних и тех же химических реакций. Это, по мнению авторов, свидетельствует о том, что реакция старше белков: сначала металлы и неорганические соединения служили катализаторами, а позднее эволюция привела к появлению специализированных белков, которые взяли на себя эти функции.
Особое внимание авторы уделили реакции фосфита с органическими молекулами, которая в присутствии палладия позволяла накапливать энергию в форме АДФ — предшественника универсального энергетического «аккумулятора» АТФ. Именно этот шаг, по их мнению, стал поворотным моментом: он связал геохимические процессы с биохимическими и объяснил, почему фосфор занял центральное место в клеточном метаболизме. Постепенно металлические катализаторы замещались более специализированными и эффективными ферментами — но в каждой из двух эволюционных линий это замещение шло независимо, разными путями.
Отсюда следует фундаментальный вывод: переход от химически активной, но еще не живой системы к полноценным свободноживущим клеткам произошел как минимум дважды. Бактерии и археи не являются потомками одной и той же первой клетки; они представляют собой две параллельные ветви, каждая из которых самостоятельно «изобрела» клеточную мембрану, механизмы деления и энергообеспечения, хотя и опиралась на единый метаболический каркас, доставшийся от LUCA.
Не все исследователи согласны с выводами авторов работы. Кристаллограф Хуан Фонтесилья-Кампс из Института структурной биологии (Франция) полагает, что LUCA мог обладать примитивной мембраной, состоящей из смеси липидов, характерных как для бактерий, так и для архей, что подразумевает единственный переход к клеточной жизни. Его поддерживает микробиолог Донато Джованнелли (Университет Неаполя), который называет работу «убедительной, но умозрительной» — по его мнению, мы никогда не сможем точно восстановить события, произошедшие три миллиарда лет назад.