«Этот вариант надолго»: омикрон — что делать?

27 января 2022 года прошло собрание Научного совета Российской академии наук «Науки о жизни» на тему «Омикрон: молекулярно-биологические особенности, эпидемиология, перспективы диагностики и терапии». Какие свойства у нового штамма, как кожная проба может показать, есть ли у человека иммунитет, как мезенхимальные стволовые клетки помогают вылечить коронавирус — в репортаже InScience.News.Ведущим собрания стал вице-президент РАН и председатель Совета академик Владимир Чехонин. Он начал свое выступление с того, что рассказал об общих признаках омикрон-штамма: его инкубационный период значительно короче, чем у «предшественника» — дельты; заболевший становится заразным в первые сутки после заражения; вирус передается в семь раз быстрее.Что нового в омикроне?Сергей Альховский, заведующий лабораторией биотехнологии ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава РФ выступил с докладом «Генетическая изменчивость SARS-CoV-2: сколько букв в греческом алфавите?». Он представил линии глобальной филогении коронавирусной инфекции. На этой схеме показаны данные о различных вариантах COVID-19, которые формировались начиная с появления вируса. На рисунке видно, что именно омикрон сейчас начинает конкурировать с вариантом дельта.Научная РоссияАльховский обратил внимание и на то, что скорость изменчивости коронавирусной инфекции в разы ниже, чем у привычного всем вируса гриппа. При этом особенно большое количество мутаций происходит в спайковом белке генома коронавируса — в той части, которая взаимодействует с иммунитетом носителя. «Вынужден заметить, что большинство замен, которые встречаются в вирусе, это замены, которые не приводят к фенотипическому изменению вируса. Те замены, которые связаны с изменениями фенотипа, — они происходят в спайк-белке и связаны с двумя процессами: адаптация вируса к рецепторам человека и изменение антигенных эпитопов, то есть антигенные дрейфы, которые нам хорошо знакомы по вирусу гриппа», — рассказал Альховский.Особую озабоченность на данный момент вызывают всем известные варианты омикрон и дельта: «Мы видим, что вирус начинает формировать различные ветви, которые в будущем будут соответствовать различным фенотипам вируса».Омикрон сам по себе имеет очень много мутаций: около 50 по всему геному, 30 из них — в спайковом белке. 15 мутаций располагаются в рецептор-связывающем домене. Это означает, что антигенные характеристики вируса очень сильно изменились. Так, омикрон может ускользать от действия большинства известных моноклональных антител. При этом нейтрализующая активность сывороток реконвалесцентов и вакцинированных снижается в 7–40 раз (но все же сохраняется). Но ревакцинация «Спутником Лайт» (или другими вариантами вакцин) восстанавливает защитное действие. Также ученые выяснили, что омикрон эффективно диагностируется существующими тестами.Кроме прочего, у омикрона в 2–4 раза выше способность связываться с человеческими рецепторами. Более того, именно этот вирус смог получить дополнительный путь инфицирования человека — с помощью формирования эндосом, через которые он проникает в клетку. Также увеличился спектр клеток, которые может поражать омикрон. Именно этим можно объяснить сниженную патогенность. То есть иммунная система гораздо эффективнее реагирует на вирус из-за того, что поражаются самые разные клетки организма.Прогноз течения болезни и тесты на иммунитетАрег Тотолян, доктор медицинских наук, профессор, академик РАН, директор Санкт-Петербургского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, рассказал об иммунологической диагностике коронавируса. Тотолян обратил внимание на возможные механизмы лимфопении при этом заболевании. «Мы прошли большой путь по изучению цитокинов. Проанализировали очень много этих молекул и обнаружили, что не только в острую фазу происходят сдвиги в части активного синтеза большого количества молекул, но и в период после перенесенной инфекции развивается временная цитокиновая недостаточность, которая характерна для цитокинов, регулирующих развитие, созревание и дифференцировку лимфоцитов. Более того, уровень цитокинов обладает прогностической информативностью. Можно узнать: положительный исход заболевания коронавирусом или летальный», — рассказал Тотолян.Также докладчик рассказал об исследованиях Санкт-Петербургского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии им. Пастера. Так, исследователи разработали кожный тест для оценки иммунитета против коронавируса. Сам по себе он очень похож на привычную всем пробу Манту. Новый тест дешевый и не требует специального оборудования, поэтому очень удобен. Анализ проводится в течение 72 часов. «У нас принято проводить испытания любой разработки на разработчиках. Мы еще в прошлом году прошли этот путь и для самих себя доказали, что этот тест работает как в случае оценки постинфекционного, так и поствакцинного иммунитета. Сейчас очень надеемся, что Минздрав даст разрешение на проведение официальных клинических испытаний», — рассказал Тотолян.Сергей Нетесов, член-корреспондент РАН, заведующий лабораторией бионанотехнологии, микробиологии и вирусологии факультета естественных наук Новосибирского государственного университета, рассказал о свойствах разных вариантов коронавируса и о его эволюционном потенциале. Например, он говорил о причинах особенно активного распространения и селекции разных типов коронавируса в Африке. Так, в ЮАР около 16% населения болеют ВИЧ. Иммунитет больных ВИЧ значительно ослаблен, что позволяет коронавирусу размножаться в организме на протяжении недель. При этом он успевает мутировать, и новый вариант затем может начать распространяться по миру.Также исследователи выяснили, что омикрон гораздо дольше выживает на пластиковых поверхностях — до 193,5 часа, гораздо больше по сравнению со своим «предшественником» — вариантом дельта, который может продержаться всего 114 часов.Нетесов рассказал о том, что российская вакцина «Спутник V» эффективна против омикрона, хотя уже и не так, как раньше. Исследователи оценивают его эффективность в 60% против тяжелого течения заболевания (против предыдущего штамма — дельты — 80–90%). «Единственный способ для нас существенно и быстро снизить число тяжелых случаев и смертность — это усиленная вакцинация и ревакцинация. Мы видим, что она сейчас усиливается, но мы что-то сильно отстаем от развитых стран. Было бы полезно запустить вакцину против омикрона, потому что, судя по всему, этот вариант надолго», — рассказал Нетесов.Георгий Базыкин, PhD Принстонского университета, профессор Сколтеха, заведующий лабораторией молекулярной эволюции Института проблем передачи информации РАН, рассказал о геномной эпидемиологии омикрона. Так, новый вариант стремительно заменяет дельту по всему миру. «Вытеснит ли он дельту полностью, или продолжит с ней сосуществовать — это открытый вопрос», — заявил докладчик. При этом вариант омикрон не является потомком дельты, так как они произошли от разных веток мутаций.Новый штамм коронавируса был завезен в Россию из Африки. Это произошло с 3 по 15 декабря 2021 года. Вскоре, 17 декабря, случилась вспышка заболеваемости коронавирусной инфекцией в общежитии в Санкт-Петербурге, где большая часть заражений была связана с омикроном.Новое лекарство от коронавирусаРоберт Чуньхуа Чжао из Института фундаментальных медицинских наук Китайской академии медицинских наук, рассказал о лечении коронавируса с помощью мезенхимальных стволовых клеток.«Изначально от коронавируса страдали преимущественно пациенты преклонного возраста с сопутствующими заболеваниями, а течение коронавирусной инфекции было во многом обусловлено состоянием иммунной системы пациента. <…> Большие опасения вызывает тот факт, что по мере своей трансформации коронавирус охватил все возрастные группы, поэтому вопрос о лечении COVID-19 стоит как никогда остро», — отметил докладчик.Эффективность вакцин обуславливается тем, на какую часть генома направлено действие антител. Если вакцина нацелена на мутировавшую часть вируса, то ее эффективность существенно снижается. Исследования показали, что по связке с рецепторами человека омикрон не уступает своему предшественнику.Чжао рассказал о том, что большинство антител не могут быть эффективными против нового штамма. «Таким образом, учитывая снижение эффективности вакцин против омикрона, нужны новые подходы», — отметил он. Например, недавние исследования показали, что Т-клеточный иммунитет, полученный в результате вакцинации, весьма эффективен против омикрона.Мезенхимальные стволовые клетки (МСК) сейчас рассматриваются учеными как один из перспективных методов лечения коронавируса. В исследовании, рассказывает Чжао, принимают участие 58 пациентов, заболевших COVID-19, 29 из них лечились с помощью нового способа. «Есть основания полагать, что мезенхимальные стволовые клетки не подвержены инфицированию коронавирусом», — заявил ученый. Это происходит от того, что эти клетки не имеют на своей поверхности особых рецепторов, за которые может зацепиться вирус. Пациенты, получившие лечение с использованием таких стволовых клеток, меньше были подвержены симптомам коронавирусной инфекции. Кроме того, у таких пациентов было меньше время госпитализации. «Таким образом, лечение с помощью МСК способствует выработке антител, действующих непосредственно на коронавирус», — отметил Чжао.Подписывайтесь на InScience.News в социальных сетях: ВКонтакте, Telegram, Facebook и Twitter.